陈自瑶早年被某周刊拍下与一名爱作男性打扮的娱乐女记者在闹巿中亲密挽手逛街，并在沙滩上依偎并激吻的亲热照。她还亲口承认是女同性恋者，并表示两人每天在一起都很开心，并不介意对方是男是女，只知道对方对她很好，能带给她温暖。她还称现在是她的事业低潮期，还好有这位“男友”陪伴。
但在出席《朱古力奖门人》首映时，陈自瑶否认自己曾承认是同性恋者。在被记者拿出两人激吻的照片追问时，陈自瑶表示自己最近不开心，该女记者当晚只是开解自己而已。当时记者看她想哭，因此不再多问，所以关于陈自瑶是否是同性恋这一问题，一直没有一个明确的答案。不过，陈自瑶如今已嫁人生子，也能证明她的性向还是正常的。
