电影《X战警：逆转未来》结局时，变种人放弃枪杀科学家，因此取得了总统的信任，总统改变主意放过变种人，取消了消灭变种人的计划，绞杀机器人不复存在，教授也没没事，未来因此而改变。
X战警在未来因为新型特种战斗机器人“哨兵”的猎杀濒临灭绝，未来挽救灭绝危机，X战警决定回到过去，借改变过去篡改未来，金刚狼罗根便是被选中的回到过去改变历史的人。
金刚狼利用幻影猫凯蒂的能力穿越回过去，要联合年轻的X教授和万磁王，找到魔形女，一起去阻止特拉斯克，阻止哨兵机器人对X战警的绞杀。
但改变的过程很难，即使在过去，总统也对变种人充满危机感，多亏变种人一时心软放过那位科学家，让总统看到了和平相处的希望，改变了变种人绞杀计划。
过去改变后，未来的变种人遭遇的一切也就不存在了，因旧离世死掉的人也复活了。在改变后的五十年间，金刚狼成了学校老师，所有人的命运都朝着不同轨迹发展。
